Ente de Control Externo:
El ente de control externo del Programa Presidencial de Derechos Humanos y Derecho Internacional Humanitario es la Contraloría General de la República. Actualmente se esta haciendo una auditoria externa al Proyecto COL 97 /004 contratada por PNUD y ejecutada por la empresa AMEZQUITA Y CIA
Ente de Control Interno
La Oficina de control interno se encarga de hacer seguimiento y evaluación de:
- Planes de mejoramiento
- Planes estratégicos
- Indicadores de gestión
- Indicadores de servidores públicos
- Mapas de riesgos
- Planes de trabajo
- Manuales de procesos y procedimientos
- Diagramación de los procesos
- Matriz Dofa